Пары 1/16 финала выглядят следующим образом:
«Енисей» — «Зенит»
«Алания» — ПФК ЦСКА
«Балтика» — «Локомотив»
«Нижний Новгород» — «Краснодар»
«Торпедо» — «Крылья Советов»
«Чайка» — «Уфа»
«Томь» — «Тамбов»
«Шинник» — «Сочи»
«КАМАЗ» — «Спартак»
«Факел» — «Арсенал»
«Чертаново» — «Оренбург»
«СКА-Хабаровск» — «Ахмат»
«Мордовия» — «Ростов»
«Луч» — «Динамо»
«Черноморец» — «Урал»
«Химки» — «Рубин»
Матчи 1/16 финала Кубка России запланированы на 25 и 26 сентября. Представители РПЛ проведут их в гостях.
