Согласно проекта розыгрыша Кубка России 2011-2012 годов, соревнования стартуют с 1/2048 финала. В первом раунде команды будут соревноваться за Кубки субъектов Российской Федерации. Во втором, так называемом межрегиональном этапе (1/1024 финала), примут участие 155 команд. На третьем отрезке (1/512 финала) десять победителей региональных кубковых турниров вступят в борьбу с представителями Второго дивизиона.
Далее структура кубкового турнира обретает привычный вид: начиная с 1/32 финала в соревнования вступают представители ФНЛ, а начиная с 1/16 финала - команды Премьер-лиги.